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簡(jiǎn)要描述:TALENs動(dòng)物模型構(gòu)建是利用TALENs基因編輯技術(shù)構(gòu)建的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型。TALENs通過融合轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物(TALE)的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域與核酸酶(FokI)的切割結(jié)構(gòu)域,能夠特異性識(shí)別并切割目標(biāo)DNA序列,從而實(shí)現(xiàn)基因組的精準(zhǔn)編輯。
詳細(xì)介紹
TALENs(Transcription Activator-Like Effector Nucleases)是一種人工工程化核酸酶,由兩部分構(gòu)成:
DNA識(shí)別域(TALE蛋白):
由 34個(gè)氨基酸的重復(fù)單元 組成,每個(gè)單元通過 第12、13位的可變氨基酸(RVDs) 特異性識(shí)別單個(gè)堿基:
RVD類型 | 識(shí)別堿基 | 結(jié)合強(qiáng)度 |
---|---|---|
NI | A | 高特異性 |
NG | T | 高特異性 |
HD | C | 高特異性 |
NN | G/A | 交叉識(shí)別 |
識(shí)別序列長(zhǎng)度通常為 15-20 bp,確保靶向wei一性。
DNA切割域(FokI核酸酶):
需形成二聚體才能切割DNA,因此TALENs需成對(duì)設(shè)計(jì)(左右臂),切割位點(diǎn)位于兩臂之間(間隔區(qū)通常為12-20 bp)。
雙鏈斷裂(DSB):
TALE結(jié)合靶序列 → FokI二聚化 → 切割DNA雙鏈。
修復(fù)路徑:
非同源末端連接(NHEJ) :隨機(jī)插入/缺失(Indels),導(dǎo)致基因敲除。
同源定向修復(fù)(HDR) :需提供外源修復(fù)模板,實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)插入或點(diǎn)突變。
技術(shù)突破:shu次實(shí)現(xiàn)任意基因組位點(diǎn)的精準(zhǔn)切割,且脫靶率低于早期ZFN技術(shù)。
步驟 | 核心操作 | 創(chuàng)新方案 |
---|---|---|
靶點(diǎn)設(shè)計(jì) | 避開重復(fù)序列/甲基化區(qū)域,間隔區(qū)優(yōu)化為14-18 bp | 軟件預(yù)測(cè)(TALEN Targeter)提升成功率 |
模塊組裝 | Golden Gate克隆法: |
6模塊串聯(lián)(+63架構(gòu))
酶切連接(BsaI/BsmBI) | 6天內(nèi)完成構(gòu)建,效率提升5倍 |
| 表達(dá)載體 | 哺乳動(dòng)物雙啟動(dòng)子載體(CMV/T7),支持細(xì)胞轉(zhuǎn)染與mRNA合成 | 適配多物種應(yīng)用(斑馬魚、小鼠、人iPS細(xì)胞) |
| 活性驗(yàn)證 | 酵母單雜交系統(tǒng)或細(xì)胞報(bào)告基因檢測(cè) | 替代耗時(shí)ES細(xì)胞打靶,周期縮短至1周 |
| 胚胎遞送 | 受精卵顯微注射:
mRNA:TALENs體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
RNP復(fù)合物:TALE-FokI蛋白復(fù)合體 | RNP減少脫靶效應(yīng),提升安全性
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